VEGF Receptor 2(KDR)靶点介绍及实验小贴士 |
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图一:VEGF Receptor 2靶点蛋白结构。图片来源:SWISS-MODEL。VEGF Receptor 2靶点介绍蛋白功能蛋白表达蛋白定位异构体 & 翻译后修饰WB实验贴士注意事项阳性对照阴性对照结果示例关键控制点参考文献VEGF Receptor 2靶点介绍蛋白功能 VEGF Receptor 2具有酪氨酸激酶活性,与VEGFA、VEGFC、VEGFD结合激活后能够介导内皮细胞的增殖、侵袭和迁移,提高血管透性和新血管形成。 成熟的VEGF Receptor 2为糖基化的跨膜蛋白,分子量为230 KDa,由胞外域(ECD)、跨膜域(TMD)、近膜域(JMD)、酪氨酸激酶域(TKD)和C端域(CTD)组成。ECD负责结合VEGF,使VEGF Receptor 2发生二聚化;TMD和JMD调控激酶活性;TKD和CTD激活信号通路。 人源VEGF Receptor 2 包含18个N-糖基化位点,15个磷酸化位点及多个ATP结合、底物结合位点,这些位点对于蛋白的折叠、激活、转录后修饰、细胞附着和功能调节具有重要作用。 VEGFR-2激活后可介导下游信号通路中许多蛋白的磷酸化(例如Akt、mTOR,Erk1/2、FAK和 p70S6K),促进肿瘤血管生成。 蛋白表达表达广泛。 血管内皮细胞、血管瘤组织中常见。 蛋白定位内质网、细胞膜。 人源VEGF Receptor 2异构体1(P35968-1):细胞膜、细胞质、内体、细胞核。() 人源VEGF Receptor 2异构体2、3(P35968-2、3):分泌至胞外。 图二:VEGF receptor 2蛋白的ICC实验结果图,Anti-VEGF Receptor 2抗体(ab233693)。绿色:VEGF receptor 2,红色:alpha Tubulin,蓝色:DAPI。异构体 & 翻译后修饰人(P35968): 异构体1:152 KDa(预测);异构体2-3:76-80 KDa(预测) 小鼠(P35918):异构体1:151 KDa(预测);异构体2:76 KDa(预测) 大鼠(O08775):151 KDa(预测) N-糖基化,磷酸化,泛素化 回到顶部 WB实验贴士注意事项在WB实验中,VEGF Receptor 2可能会检测到多条条带,因为在人和小鼠中,VEGF Receptor 2不仅有多个异构体,还存在翻译后修饰。 VEGF Receptor 2是跨膜蛋白,建议提取膜蛋白来进行WB检测。 VEGF Receptor 2容易降解,在WB实验中,建议使用新鲜的裂解液,当天完成样品制备和跑胶,避免裂解液反复冻融。 VEGF Receptor 2的磷酸化修饰可能需要条件诱导(例如使用ab5475时,HT-29/Caco-2需要先进行血清饥饿,再添加100 ng/mL of SCF处理10min),有助于解决信号弱或者无信号现象。 阳性对照HUVEC全细胞裂解液 阴性对照Jurkat, HeLa, K562, NIH/3T3HUVEC 全细胞裂解液 结果示例图三:WB- VEGF Receptor 2 (EPR21884-290)抗体产品(ab221679)。泳道1:小鼠胎盘组织裂解液(20ug)。泳道2:大鼠胎盘组织裂解液(20ug)。泳道3:大鼠肺组织裂解液(20ug)。泳道4:小鼠肺组织裂解液(20ug)。泳道5:bEnd.3(小鼠脑血管内皮瘤细胞系)全细胞裂解液(10ug)。 预测条带大小:152 KDa检测条带大小:180-230 KDa关键控制点在实验中除了需要注意常规问题外,还要特别关注以下关键控制点: 样本制备 添加足够量的复合蛋白酶抑制剂以避免靶标蛋白降解。 选择合适的裂解液来富集更多靶标蛋白。 整个样本制备过程中,保持样本置于冰上。 通过Bradford分析、Lowry分析或BCA分析测定样本总蛋白浓度。 电泳 至少上样20μg总蛋白进行电泳。 对于分子量较大的靶标蛋白,建议使用较低浓度的分离胶进行电泳。 转膜 对于分子量较大的靶标蛋白,建议在转膜缓冲液中加入SDS至终浓度为0.1%。 对于分子量较大的靶标蛋白,建议使用0.45μm的PVDF膜。 对于分子量较大的靶标蛋白,建议转膜缓冲液中使用10%甲醇或更低浓度。 建议转膜完成后使用丽春红染色,确定转膜是否成功(如果选择荧光标记检测,请确保丽春红完全清洗干净)。 封闭 没有适用于所有体系的封闭液,请选择合适的封闭液。 回到顶部参考文献Veli-Matti Leppanen, Andrea E Prota, Michael Jeltsch et al. Structural determinants of growth factor binding and specificity by VEGF receptor 2. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (2010). 107(6): 2425–2430.doi: 10.1073/pnas.0914318107 T Takahashi, M Shibuya. The 230 kDa mature form of KDR/Flk-1 (VEGF receptor-2) activates the PLC-gamma pathway and partially induces mitotic signals in NIH3T3 fibroblasts. Oncogene (1997). 14(17): 2079–2089. doi: 10.1038/sj.onc.1201047Xinrong Wang, Alfredo Maria Bove, Giuseppe Simone et al. Molecular bases of VEGFR-2-mediated physiological function and pathological role. Front Cell Dev Biol (2020). 8: 599281.doi: 10.3389/fcell.2020.599281Lingfang Zeng, Qingzhong Xiao, Mei Chen et al. Vascular endothelial cell growth-activated XBP1 splicing in endothelial cells is crucial for angiogenesis. Circulation (2013).127(16): 1712-1722.doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.112.001337 Farah Khayati, Laura Pérez-Cano, Kamel Maouche et al. EMMPRIN/CD147 is a novel coreceptor of VEGFR-2 mediating its activation by VEGF. Oncotarget (2015). 6(12): 9766-9780.doi: 10.18632/oncotarget.2870Zhaocheng Zhang, Kathleen G. Neiva, Mark W. Lingen et al. VEGF-dependent tumor angiogenesis requires inverse and reciprocal regulation of VEGFR1 and VEGFR2. Cell Death Differ(2010). 17(3):499-512.doi: 10.1038/cdd.2009.152 |
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